Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
F11rO88792 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
F11rO88792 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
F11rO88792 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms