Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema3fO88632 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema3fO88632 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema3fO88632 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema3fO88632 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema3fO88632 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3fO88632 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms