Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CntfrO88507 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms