Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Capns1O88456 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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