Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnk4O88454 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Kcnk4O88454 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnk4O88454 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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