Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx3O70492 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx3O70492 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms