Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xirp1O70373 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms