Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Foxq1O70220 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Foxq1O70220 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Foxq1O70220 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Foxq1O70220 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Foxq1O70220 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Foxq1O70220 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Foxq1O70220 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Foxq1O70220 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Foxq1O70220 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Foxq1O70220 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxq1O70220 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Foxq1O70220 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Foxq1O70220 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Foxq1O70220 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Foxq1O70220 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Foxq1O70220 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Foxq1O70220 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Foxq1O70220 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Foxq1O70220 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Foxq1O70220 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Foxq1O70220 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxq1O70220 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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