Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syngr1O55100 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms