Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc3O55013 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms