Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
CrxO54751 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
CrxO54751 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CrxO54751 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CrxO54751 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms