Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EdaO54693 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EdaO54693 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EdaO54693 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EdaO54693 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EdaO54693 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EdaO54693 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EdaO54693 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EdaO54693 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EdaO54693 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EdaO54693 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EdaO54693 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EdaO54693 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EdaO54693 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EdaO54693 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EdaO54693 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms