Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sdc4O35988 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sdc4O35988 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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