Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bnc1O35914 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms