Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Klf9O35739 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms