Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn6O35646 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn6O35646 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn6O35646 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Capn6O35646 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms