Protein–RNA interactions for Protein: O35405

Pld3, Phospholipase D3, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld3O35405 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pld3O35405 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pld3O35405 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pld3O35405 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms