Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd2O35392 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxd2O35392 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms