Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcc1O35379 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcc1O35379 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms