Protein–RNA interactions for Protein: O35242

Nsmaf, Protein FAN, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmafO35242 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NsmafO35242 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NsmafO35242 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmafO35242 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmafO35242 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmafO35242 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmafO35242 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmafO35242 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmafO35242 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmafO35242 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmafO35242 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmafO35242 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmafO35242 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmafO35242 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmafO35242 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmafO35242 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmafO35242 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NsmafO35242 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NsmafO35242 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NsmafO35242 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NsmafO35242 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NsmafO35242 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NsmafO35242 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NsmafO35242 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmafO35242 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NsmafO35242 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms