Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhe40O35185 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe40O35185 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms