Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra3O35118 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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