Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Scarb2O35114 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scarb2O35114 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scarb2O35114 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scarb2O35114 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scarb2O35114 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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