Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kif1cO35071 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kif1cO35071 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms