Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn4O35054 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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