Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EllO08856 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EllO08856 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
EllO08856 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EllO08856 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms