Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Efna3O08545 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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