Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms