Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3239L7N2D9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms