Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms