Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm2056J3QQ02 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm2056J3QQ02 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms