Protein–RNA interactions for Protein: J3QP72

Gm21738, Predicted gene, 21738, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21738J3QP72 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21738J3QP72 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms