Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3336J3QMQ6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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