Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930544D05RikJ3QK56 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930544D05RikJ3QK56 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms