Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem200cJ3QK46 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem200cJ3QK46 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms