Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20828J3KMI7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20828J3KMI7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms