Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn20G5E8X0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn20G5E8X0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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