Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcf11G3X9Z4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcf11G3X9Z4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms