Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vmn1r58G3X9U3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms