Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmgxb3G3X9M3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmgxb3G3X9M3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms