Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r39G3UWE6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r39G3UWE6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms