Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3443F7CCV5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms