Protein–RNA interactions for Protein: F6XZJ7

Samd15, Sterile alpha motif domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd15F6XZJ7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Samd15F6XZJ7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Samd15F6XZJ7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms