Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Crocc2F6XLV1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Crocc2F6XLV1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms