Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm28305F6U473 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm28305F6U473 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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