Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Rdh16f1E9Q9P8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Rdh16f1E9Q9P8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Rdh16f1E9Q9P8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Rdh16f1E9Q9P8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Rdh16f1E9Q9P8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Rdh16f1E9Q9P8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rdh16f1E9Q9P8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rdh16f1E9Q9P8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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