Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga10E9Q6R1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga10E9Q6R1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms