Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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FancfE9Q5Z5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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FancfE9Q5Z5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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FancfE9Q5Z5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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FancfE9Q5Z5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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FancfE9Q5Z5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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FancfE9Q5Z5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FancfE9Q5Z5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancfE9Q5Z5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancfE9Q5Z5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancfE9Q5Z5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancfE9Q5Z5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancfE9Q5Z5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FancfE9Q5Z5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FancfE9Q5Z5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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FancfE9Q5Z5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FancfE9Q5Z5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FancfE9Q5Z5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FancfE9Q5Z5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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