Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DspE9Q557 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DspE9Q557 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms