Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pgbd1E9Q492 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pgbd1E9Q492 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pgbd1E9Q492 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pgbd1E9Q492 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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